La Chiesa, di struttura imponente, fu fatta erigere da Giovanni Pisano nel 1304. Intorno al 1614 crollarono volte e pilastri della navata e a seguito della ricostruzione ad opera di Carlo Maderno di Roma, la chiesa fu di nuovo consacrata nel 1632. All'interno si trovano opere gotiche, vetrate rinascimentali e il monumento dedicato a papa Benedetto XI. Il complesso religioso comprende anche il Museo Archeologico dell'Umbria e l'Archivio di Stato.